鳄鱼龟是肉食动物，但同样也吃腐食，而且年幼的鳄龟也会吃吃植物。其实喂养鳄鱼龟的食物有很多。如，活虾，蚶子，贝壳类，鱼苗，活的小鱼苗，米饭，熟米饭，新鲜牛羊猪瘦肉，新鲜的绿色蔬菜，苹果，梨等等，这些都可以成为鳄鱼龟的食物。

尤其是活食，比如小鱼、小虾、泥鳅等等。还有，新鲜的瘦肉和动物内脏它们也很喜欢吃。若是喂活食，最好先消消毒，然后切碎再喂。

在人工饲养的时候，可以为它准备小鱼虾、螺、蚌、昆虫、蚯蚓、蚕蛹、蝇蛆、黄粉虫、各种畜禽内脏和下脚料及膨化饲料等食物，然后在搭配一些新鲜的蔬菜瓜果喂食即可。

辅以一些泡软的小麦、碎玉米与蔬菜、水草等，还要适当添加维生素、微量原素与钙等。

幼龟的食物主要是小鱼，死鱼、无脊椎动物、腐肉及两栖动物都是它们的食物，也会吃蛇或其他龟，有时也吃鸟。